日前，由中國科學(xué)院昆明植物研究所、云南省熱帶作物科學(xué)研究所、華南農(nóng)業(yè)大學(xué)基因組學(xué)與生物信息學(xué)研究中心組成的聯(lián)合研究團(tuán)隊(duì)利用單分子實(shí)時(shí)測序(SMRT)和Hi-C技術(shù)，獲得達(dá)到染色體級(jí)別的高質(zhì)量巴西橡膠樹優(yōu)良品種GT1的參考基因組序列；該研究歷時(shí)6年，獲得的基因組圖譜在組裝準(zhǔn)確性與完整性上都得到了極大的提升，將組裝獲得的約1.47Gb的基因組序列掛載到了18條假染色體上。

橡膠樹的高產(chǎn)、抗病、抗旱、抗寒等重要經(jīng)濟(jì)性狀的基因組選擇育種與優(yōu)異基因資源的發(fā)掘利用，也亟需獲得達(dá)到染色體級(jí)別的高質(zhì)量橡膠樹參考基因組圖譜。該研究獲得的參考基因組序列是國際上首次達(dá)到染色體級(jí)別的基因參考圖譜，揭示大戟植物基因組的染色體進(jìn)化、膠乳生物合成與橡膠樹的馴化。構(gòu)建了第一張代表性野生和栽培橡膠樹的基因組變異精準(zhǔn)圖譜，獲得約1570萬個(gè)高質(zhì)量的SNPs；解析了膠乳生物合成途徑及重要基因的表達(dá)式樣，發(fā)現(xiàn)與基礎(chǔ)代謝過程、乙烯生物合成以及與乳膠停排相關(guān)的多糖和糖蛋白凝集素活動(dòng)相關(guān)基因的顯著擴(kuò)張。

中國的橡膠種植面積達(dá)114萬公頃，居亞洲第三位(僅次于印度尼西亞和馬來西亞)，，云南的橡膠樹種植總面積、總產(chǎn)量和單位面積產(chǎn)量均居中國首位，但年產(chǎn)不足。巴西橡膠樹這一重要參考基因組的獲得、膠乳生物合成代謝通路的解析、栽培和野生橡膠樹基因組變異精準(zhǔn)圖譜的構(gòu)建以及栽培橡膠樹馴化的認(rèn)識(shí)，對(duì)中國未來橡膠優(yōu)異種質(zhì)資源的保護(hù)、發(fā)掘與育種利用具有重要意義。